Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agtpbp1Q641K1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agtpbp1Q641K1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms