Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms