Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp248Q640N4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms