Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc18Q640L5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc18Q640L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms