Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PatjQ63ZW7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms