Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nptx1Q62443 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms