Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp1Q62442 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms