Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr2Q62312 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms