Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spock1Q62288 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms