Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ss18Q62280 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ss18Q62280 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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