Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sall3Q62255 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sall3Q62255 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sall3Q62255 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sall3Q62255 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms