Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5dQ62240 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5dQ62240 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5dQ62240 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms