Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssr4Q62186 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms