Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2aQ62066 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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