Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrn1Q61809 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrn1Q61809 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrn1Q61809 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms