Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hes3Q61657 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms