Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms