Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne1Q61457 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccne1Q61457 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms