Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsx2Q61412 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms