Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcolceQ61398 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PcolceQ61398 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcolceQ61398 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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