Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OclnQ61146 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OclnQ61146 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OclnQ61146 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms