Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scarb1Q61009 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scarb1Q61009 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb1Q61009 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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