Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Laptm4aQ60961 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms