Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms