Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik1Q60934 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms