Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ppp1r1bQ60829 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp1r1bQ60829 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms