Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms