Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms