Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms