Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd4Q60688 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms