Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgaeQ60677 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms