Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sin3aQ60520 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms