Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf1Q5U4C3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms