Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brip1Q5SXJ3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms