Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc42Q5SV66 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms