Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd40Q5SUE8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms