Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms