Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r223Q5SSA0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms