Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RilpQ5ND29 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RilpQ5ND29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms