Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms