Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a8Q5HZH7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a8Q5HZH7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms