Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynaQ5G5D5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynaQ5G5D5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms