Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp22Q5DU02 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms