Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Fam208bQ5DTT3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam208bQ5DTT3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam208bQ5DTT3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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