Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eme2Q56A04 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms