Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrig2Q52KR2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms