Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3K7

Gcnt7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt7Q3V3K7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcnt7Q3V3K7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms