Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms