Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm906Q3V0M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm906Q3V0M1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms