Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930567H17RikQ3V0K5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms